疾管署指出，今年東南亞登革熱疫情異常嚴峻，境外移入病例數為近十年來之同期次高，疫情分布於全國18縣市。本土病例除高雄市、臺北市、新北市已出現零星病例，於屏東縣持續增加。
依據研究資料顯示，如單日累積降雨量大於80毫米或單週累積降雨量大於200毫米時，預期一個半月至兩個月後，登革熱疫情發生之風險將會升高。該署呼籲，登革熱尚無有效的疫苗或藥物可以預防或治療，目前公認最有效的防治方法，落實清除病媒蚊孳生源，由於即將進入往年10月、11月之本土登革熱高峰期，提醒社區民眾務須於下雨過後加強動員，落實清除戶內外環境的積水容器，並進行容器減量等防治工作，平時亦應定期巡查，以降低登革熱流行風險。
10月1日起實施公費流感疫苗接種
接種對象包括65歲以上老人、6個月以上至國小6年級學童、安養養護機構受照顧者、醫事防疫人員、禽畜養殖相關人員、重大傷病患者及60～64歲高風險慢性病患（今年新增對象）等7類。
為使聽損兒童能早期發現、及早療育，降低學習障礙，臺北市於98年9月起率先推出「新生兒聽力篩檢推廣計畫」，針對新生兒在出生24到36小時進行聽力篩檢，篩檢疑似異常者進行確診與個別療育追蹤照護。100年推廣至新北市，衛生福利部國民健康署於101年3月於全國推廣補助。臺北市政府衛生局提醒，新生兒如未通過聽力篩檢者，請在3個月內完成確診，建議在6個月內配戴聽覺輔具與接受聽語療育，讓聽損兒可達到接近正常的語言和身心發展。
為進一步守護新生兒的心臟健康，臺北市政府將自102年10月1日起試辦出生24至36小時之新生兒脈衝血氧飽和度篩檢補助，藉由檢測及早發現罹患「危急型先天心臟病」之新生兒，並協助轉介確診、治療。
臺北市政府衛生局林奇宏局長表示，脈衝式血氧飽和度檢測為非侵入性、具安全性且具成本效益的篩檢方式，新生兒出生24～36小時接受新生兒聽力篩檢時，可同步進行脈衝血氧飽和度檢測；初步由臺北市立聯合醫院、臺北榮總、三軍總醫院及臺北馬偕等12家醫療院所先行試辦，凡於特約醫療院所出生的新生兒將免費提供脈衝式血氧飽和度檢測，並針對不通過檢測之新生兒，儘速安排確診相關檢查；非於本市試辦之特約醫療院所出生7日內的新生兒，可至臺北市立聯合醫院和平婦幼（婦幼）院區免費檢測，以達早期發現、及早治療、降低危急型先天心臟病的危害。試辦成效評價良好，預計明年開始全面推動。
臺灣地區每1,000位新生兒中約有1-2名罹患「危急型先天心臟病」，且於出生一年內（大多數於一個月內）需要外科手術矯正或心導管治療的先天心臟病；歐美國家已陸續將脈衝血氧飽和度檢測列為危急型先天心臟病法定常規篩檢項目，危急型先天心臟病檢出率約75%。
