當精子與卵子相遇的那一刻，就已經決定寶寶的性別，但究竟為什麼性別能夠使男、女生出現身體構造與外在行為的不同？其實這與基因組合和荷爾蒙分泌有關。正常來說，人類共有23對基因、46條染色體，22對是體染色體，男女皆同，最後一對則為性染色體，男性的組合為XY、女性的組合為XX，其中，Y、X染色體能分別促進大腦大量分泌男性、女性的荷爾蒙，發展出男性和女性的器官和樣貌。
財團法人天主教聖母聖心會懷仁全人發展中心諮商心理師林純如表示，在胚胎發育的0～4週時，不論是男孩或女孩，皆以女孩的XX染色體組合成長，直到6～8週時，男孩的Y染色體才會開始發揮作用，分泌男性荷爾蒙當中的睪固酮，此時男孩便長出男性器官，發展出男性的外貌。不過，睪固酮在男孩出生約3個月後，分泌量就會開始下降，因此，男、女孩在出生3個月後，在行為和認知發展上不會有太大落差，直到4歲左右，男孩睪固酮分泌量又開始明顯增加，使男孩外在行為較為活潑好動，但到5歲時，分泌量又會開始下降，男孩就能夠靜下心來學習新事物。
至於女孩方面，基因染色體組合為XX，是胚胎原始設計的樣貌，因此，無論在生理或心理發展，都會比男孩順利。此外，由於女孩體內含大量的雌激素、黃體素等女性荷爾蒙，這些激素不僅可以加深女孩特徵，雌激素亦能促進大腦連結，使女孩在學習與理解能力都強過男孩。直到男、女生進入青春期時，又會開始出現變化，因為在青春期之前，男性沒有大量分泌男性荷爾蒙，生長較緩慢，進入青春期後就會大量分泌睪固酮，故開始快速成長。
人的大腦可分為左腦與右腦，連結兩邊腦部發展的因子稱為胼胝體，通常小女孩大腦內的胼胝體發育較好，外型也較厚實，因此，女孩在思考時會運用到左右腦，男孩則傾向只使用左腦。
由於男生左腦較發達，故左腦掌控主要行為模式，思考時較具邏輯性，處理事情較為專心，會直接注意到關鍵點，容易忽略小細節，並且傾向盡快解決事件、重視結果；女生則在思考時會同時運用左右腦，較能夠注意到事件的各個細節，也容易被情緒或外在環境所牽絆，因此，在處理事情時，較無法立刻找出方法解決。舉例來說，一般年紀較小的男孩與同儕在搶同一個玩具時，傾向直接用肢體暴力解決，但女孩則不然，會先觀察對方的狀況再思考自己處於優勢或劣勢，若處於優勢，可能會靠溝通方式將玩具搶過來，若處於劣勢則會告訴周遭的大人，進而幫助解決事件。
此外，女孩先天的五感能力較好，看事情較為全面，亦會在乎自己與他人的感受，進而找出適切的解決方式；男孩則屬於線性思考，注重結果。根據許多統計資料顯示，男性偏向理性，女性較為感性。
